Le présent document regroupe les méthodes utilisées et les résultats obtenus lors de la mission effectuée par le N.O. ALIS dans le lagon sud-ouest de Nouvelle-Calédonie, du 9 juillet au 10 août 1990. Des enceintes d'incubation ont été mises en oeuvre pour : 1-évaluer le métabolisme aérobie et calculer les flux de sels nutritifs à l'interface eau-sédiment; 2-estimer les flux d'ammonium après enrichissement du milieu; 3-juger de l'action d'un inhibiteur de la photosynthèse, le DCMU (Dichlorophenyl-dimethylurée). La concencration en oxygène de chaque enceinte a été mesurée par une sonde polarographique (YSI 58) reliée à un oxymètre protégé dans un caisson étanche. Au total, 15 stations réparties sur les trois types de fonds reconnus dans le lagon (fonds envasés, fonds de sables gris et fonds de sables blancs) ont été échantillonnées. En premier lieu, trois incubations ont été réalisées à l'obscurité pendant deux heures sur chaque station, pour mesurer les flux d'oxygène et de sels nutritifs
